Лиманська, Т. С. Аналіз невпорядкованих ділянок білка АІМР1/р43 мультисинтетазного комплексу людини методами біоінформатики / Т. С. Лиманська, О. Ю. Нипорко, О. І. Корнелюк // Доповіді Національної Академії наук України : Науково-теоретичний журнал. - 2016. - № 6. - С. 103-111 : ил. - Бібліогр. в кінці ст. - В ОБЛ. БІБЛІОТЕКІ . - ISSN 1025-6415
Загальна біофізика Биология Общая биофизика Кл.слова (ненормовані): вторинна структура -- амінокислотний залишок -- молекули білка -- невпорядкована структура -- лізин -- глютамат -- молекулярна біологія -- обчислювальна молекулярна динаміка -- вторичная структура -- аминокислотный остаток -- молекулы белка -- неупорядоченные участки -- лизин -- глютамат -- молекулярная биология -- вычислительная молекулярная динамика Анотація: Особливостi вторинної структури та розташування невпорядкованих дiлянок у структурi бiлка АIМР1 — компонента мультисинтетазного комплексу людини — дослiджено за допомогою ряду in silico пiдходiв. Виявлено, що найдовша дiлянка бiлка, яка тяжiє до формування невпорядкованої структури, розташовується з 103 по 148 амiнокислотний залишок. Цiкаво, що в межах цiєї дiлянки (приблизно з 121 по 140 залишок) також можлива наявнiсть ?-спiралi. Це удаване протирiччя досить просто пояснюється тим, що вiдповiдна дiлянка насичена як залишками лiзину (маркер невпорядкованих дiлянок бiлка), так i залишками глютамату (типовий маркер саме ?-спiральних елементiв). З великою часткою ймовiрностi можна припустити, що ця спiраль є метастабiльною, тобто такою, що переходить до невпорядкованого стану i назад внаслiдок природних флуктуацiй молекули бiлка. Дод.точки доступу: Нипорко, О. Ю.; Корнелюк, Олександр Іванович (член-кореспондент НАН України) |